Avogadro est un puissant logiciel pour dessiner et visualiser des structures moléculaires en 3D. Ainsi, à l'aide des éléments du tableau périodique et d'autres outils, vous pourrez créer des structures simples, doubles ou triples, avec différents éléments colorés comme le carbone, l'azote, l'oxygène, etc.
L'outil dispose également de structures moléculaires prédéfinies comme l'ADN, l'ARN et des cellules unitaires que vous pouvez insérer facilement dans le dessin. La plateforme permet aussi d'ajouter des effets d'animation comme la rotation automatique et bien sûr d'éditer le dessin réalisé.
Comment utiliser l'éditeur de molécules
Une fois le logiciel téléchargé depuis son site officiel, vous remarquerez que son interface est assez simple. Bien sûr, il faut savoir ce que vous faites et connaître parfaitement la discipline, mais il est supposé que si vous utilisez l'outil, c'est parce que - au minimum - vous vous en sortez. Ensuite, vous pourrez dessiner des structures moléculaires en très peu d'étapes et avec une relative facilité.
Sur la partie gauche de l'interface, vous trouverez un menu déroulant qui vous permet de sélectionner l'élément. L'élément s'insère automatiquement à la position du curseur avec l'atome d'hydrogène, mais si vous ne voulez pas cela, désactivez l'option Adjust Hydrogens.
Pour ajouter l'élément dans la zone de travail, il suffit de cliquer dessus. Pour éditer le dessin, vous pouvez utiliser la souris, les raccourcis clavier ou les fonctionnalités de la plateforme situées en haut : outil de navigation, outil de manipulation d'angle, outil de sélection, outil de rotation automatique, outil d'optimisation automatique, outil de mesure, outil de changement de couleur et outil d'alignement. Avec toutes ces fonctions, vous pourrez créer une très bonne structure chimique puis l'exporter au format CML.
La plateforme offre sans aucun doute un environnement très simple et puissant pour l'édition et la visualisation de molécules, le tout dans l'espace 3D. Ainsi, l'outil est un très bon logiciel pour les étudiants comme pour les professionnels. Avogadro est un programme gratuit disponible pour les systèmes d'exploitation Windows, Mac OS X et Linux.
