Avogadro is een krachtig programma om moleculaire structuren in 3D te tekenen en te visualiseren. Zo kun je, met behulp van de elementen van het periodiek systeem en andere hulpmiddelen, eenvoudige, dubbele of drievoudige structuren maken, met verschillende gekleurde elementen zoals koolstof, stikstof, zuurstof, enzovoort.
Het hulpprogramma bevat ook vooraf gedefinieerde molecuulstructuren zoals DNA en RNA en eenheidscellen die je eenvoudig in de tekening kunt invoegen. Het platform maakt het ook mogelijk om animatie-effecten toe te voegen, zoals automatische rotatie, en natuurlijk de gemaakte tekening te bewerken.
Hoe gebruik je de moleculeneditor
Eenmaal gedownload van de officiële website, zul je zien dat de interface vrij eenvoudig is. Natuurlijk moet je weten wat je doet en de discipline door en door kennen, maar als je dit hulpprogramma gebruikt, is dat waarschijnlijk omdat je er op zijn minst handig mee bent. Je kunt molecuulstructuren in een paar stappen en relatief eenvoudig tekenen.
Aan de linkerkant van de interface vind je een vervolgkeuzemenu waaruit je het element kunt selecteren. Het element wordt automatisch op de cursor geplaatst samen met het waterstofatoom, maar als je dat niet wilt, schakel je de optie 'Adjust Hydrogens' uit.
Om het element aan het werkgebied toe te voegen, klik je er gewoon op. Om de tekening te bewerken, kun je de muis, de sneltoetsen of de functies van het platform bovenaan gebruiken: navigatiehulpmiddel, hoekmanipulatietool, selectietool, automatische rotatietool, automatische optimalisatietool, meetinstrument, kleurveranderingsinstrument en uitlijningsinstrument. Met al deze functies kun je een zeer goede chemische structuur maken en deze vervolgens exporteren in CML-formaat.
Het platform biedt ongetwijfeld een eenvoudige en krachtige omgeving voor het bewerken en visualiseren van moleculen, allemaal in de 3D-ruimte. Daarmee is het een zeer goed hulpmiddel voor zowel studenten als professionals. Avogadro is een gratis programma dat beschikbaar is voor Windows, Mac OS X en Linux.
